Wolfgang Zerer nasceu em Passau (Alemanha) em 1961.

Iniciou os seus estudos musicais com o organista da Catedral de Passau, Walther Schuster. Em 1980, ingressou na Faculdade de Música e Artes Cénicas de Viena onde estudou órgão com Michael Radulescu, direção com Karl Österreicher e, posteriormente, cravo com Gordon Murray, além de Música Sacra. Também estudou cravo com Ton Koopman em Amesterdão e música sacra em Stuttgart (órgão com Ludger Lohmann).

Wolfgang Zerer foi premiado em diversos concursos internacionais entre os quais, Bruges em 1982 e Innsbruck em 1983.

Após lecionar nas universidades de música de Stuttgart e Viena, foi nomeado professor de órgão na Universidade de Música e Teatro de Hamburgo em 1989. Também leciona no Conservatório Prins Claus em Groningen (desde 1995) e na Schola Cantorum em Basileia/Suíça (2006-2022).

Wolfgang Zerer realizou concertos e master classes em quase toda a Europa, Israel, América do Norte e do Sul, África do Sul e Ásia (Japão, Coreia e China).