Natural de Bragança (Sé), João Carlos Pinto Gomes realizou os estudos em Órgão no Instituto Gregoriano de Lisboa, tendo como professores João Vaz e António Esteireiro.

Participou em diversas Masterclass de Órgão com alguns organistas de renome internacional, tais como Hans-Ola Ericson, Stefan Baier e José Luis Gonzales Uriol.

Entre 2008 e 2011, frequentou o IV Curso de Música Litúrgica, em Fátima, onde teve como professor de Órgão o atual Mestre-Capela da Igreja da Lapa (Porto), Filipe Veríssimo.

Colaborou, como organista, com a Paróquia de Santa Maria de Belém (Mosteiro dos Jerónimos, Lisboa) de 2009 a 2010.

Ordenado sacerdote a 8 de dezembro de 2012 no Mosteiro de Pedroso, é atualmente o Pároco da Paróquia de São Pedro de Pedroso.